Lọc vi sinh có tác dụng hút các hạt bụi và mùn bẩn trong nước vào trong bể mặt của nó làm cho bể nước trong trong sạch và là nơi cư chú của các vi sinh vật có lợi để phân hủy các chất mùn cũng như các chất hữu cơ trong nước trong hồ có chất lượng nước tốt để cá sinh sản và phát triển tốt mà không bệnh
Lọc vi sinh chỉ nên sử dụng cho cá bể cá nhỏ và nuôi các loại cá bé như : bẩy màu, tép, …. vì nó không tạo ra dòng chảy mạnh gây hại cho cá ,cây hoặc tép